以上消化道出血最为常见。 1、上消化道出血：是晚期血吸虫病患者最为严重的并发症。由于晚期血吸虫病患者出现肝纤维化门脉高压，淤积在门脉系统内的血液经门腔静脉间的交通支流入体内循环，交通支扩张形成静脉曲张。食管或胃底粘膜下的曲张静脉缺乏坚强的组织遮盖，容易发生怒张，故出血常发生于食管下段或胃底静脉曲张者。在晚期血吸虫病患者的死亡原因中，上消化道出血占50％以上。临床上为大量呕血和黑粪，出血量大，常反复发作，可引起出血性休克，后期病死率约15％。大量出血者，由于大量血液和蛋白质损失，肝缺血缺氧，以及肠道积血吸收，血氨增高，易诱发肝昏迷，或出现腹水，黄疸。 2、肝性昏迷：也是晚期血吸虫病的一种严重的并发症。并发肝性昏迷者占晚期患者总例数的1.6％～5.4％。以腹水型为最多，次为巨脾型。病死率在70％以上。肝性昏迷患者半数以上有如上消化道出血、利尿剂使用不当、外科手术、感染等诱因，临床表现与其他原因引起的肝性昏迷的表现相仿。 3、结肠癌：血吸虫病结肠肉芽肿可并发结肠癌，多为腺癌，恶性程度较低，转移较晚，早期手术预后较好。 4、乙型肝炎：日本血吸虫病患者常与乙型肝炎病毒合并感染，尤以晚期患者多见，国内报道晚期患者的乙型肝炎病毒感染率可达31％～60％，明显高于慢性血吸虫病患者。这些患者的临床表现和肝脏病理变化均较严重。肝功能可长期不正常，有肝硬化的症状和体征，病理变化为混合性肝硬化。