卫生部10日公布的2004年9月疫情中，报告发病数居前五位的病种为：肺结核、乙型肝炎、细菌性和阿米巴性痢疾、淋病、梅毒，占发病总数的87.36%；死亡数居前五位的病种为：狂犬病、肺结核、乙型肝炎、艾滋病、新生儿破伤风，占死亡总数的81.08％。
全国31个省、直辖市、自治区均有疫情报告。27种法定甲、乙类传染病中，脊髓灰质炎、传染性非典型肺炎无病例报告，其它传染病共报告病例数338281例，死亡报告总数为576例。
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